この質問への答え

OBD検査（検査用スキャンツール）は、保安基準に適合しないDTC（特定DTC）を読み取ります。
使用する整備用スキャンツールがOBD検査対象装置のすべてのDTCを読み取るものであれば、整備用のスキャンツールで検出されなかった故障コード（DTC）が特定DTC照会アプリで検出されることはありません。